Différence entre Southern blot et western blot

Auteur: Monica Porter
Date De Création: 22 Mars 2021
Date De Mise À Jour: 17 Peut 2024
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Différence entre Southern blot et western blot - Science
Différence entre Southern blot et western blot - Science

Contenu

Différence principale

La principale différence entre le Southern blotting et le western blot réside dans le fait que le Southern blotting est une technique permettant de détecter un fragment d’ADN spécifique dans un échantillon donné, tandis que le Western blotting est utilisé pour rechercher une protéine spécifique dans un échantillon donné.


Southern Blot contre. Western Blot

Le blotting est une technique utilisée par les scientifiques pour séparer différents types de molécules d'un mélange ou d'un échantillon. Dans cette technique, les macromolécules telles que les acides nucléiques (ADN et ARN) et les protéines contenues dans un mélange se déplacent à travers une plaque de gel. Ici, les particules infimes se déplaceront plus rapidement que les plus grosses. Ces molécules sont pressées contre la surface d'une membrane immobilisée qui transfère les molécules sur la membrane. Il existe différents types de transfert sur la base de la détection de matériel spécifique, à savoir le transfert Southern, le transfert Northern et le transfert Western. Le transfert de Southern est le type de transfert utilisé pour détecter l'ADN, tandis que le transfert de Western est utilisé pour détecter une protéine. Le Southern blot a été développé par Edward M. Southern en 1975. Il est donc connu sous le nom de Southern blot. D'autre part, le Western blot a été développé par le groupe de George Stark à l'université de Stanford en 1979. Ce nom était utilisé pour correspondre au Southern blot. Le transfert de Southern est utilisé pour rechercher une séquence d'ADN spécifique, tandis que le transfert de Western est utilisé pour rechercher une séquence spécifique d'acide aminé ou de protéine.


Tableau de comparaison

Southern BlotWestern Blot
Une technique utilisée pour rechercher une séquence d'ADN spécifique dans un mélange donné est connue sous le nom de transfert Southern.Une technique utilisée pour rechercher une séquence spécifique d'acides aminés de la protéine dans un mélange donné est connue sous le nom de transfert Southern.
Développé par
Southern blot a été développé par Edward M. Southern en 1975.Le Western blot a été développé par le groupe de George Stark à l’Université de Stanford en 1979.
Type de détection
Le transfert de Southern est utilisé pour trouver une séquence d'ADN spécifique.Le Western Blot est utilisé pour trouver un acide aminé spécifique ou une séquence protéique.
Principe
Cela fonctionne sur le principe de l'hybridation.Il fonctionne sur le principe de la méthode d'immunodétection ou de l'interaction antigène-anticorps.
Sonde
Un ADN simple brin ou parfois un ARN est utilisé comme sonde.Les anticorps primaires et secondaires sont utilisés comme sonde.
Électrophorèse sur gel
L'électrophorèse sur gel d'agarose est utilisée dans le transfert de Southern.SDS PAGE / Gel de Polyacrylamide utilisé pour séparer les protéines dans le Western Blot
Procédure de transfert
Southern blot suit la procédure de transfert capillaire.Western Blotting suit la procédure de transfert électrique.
Échantillon
Pendant le transfert Southern, l’échantillon doit être dénaturé.Lors du Western Blot, l’échantillon doit être dans son état natal.
Blocage
Aucune étape comme le blocage n’est impliqué dans le transfert de Southern.Pendant le transfert Western, des sites d'anticorps non spécifiques sont bloqués sur le papier de nitrocellulose à l'aide de poudre de lait ou de sérum albumine bovine (BSA).
Méthodes d'étiquetage
Les méthodes de marquage couramment utilisées dans le transfert d'empreinte par la méthode Southern sont l'utilisation de colorants chromogènes, le marquage radioactif ou le marquage fluorescent, etc.Les méthodes de marquage utilisées dans le Western Blot sont l'utilisation d'anticorps marqués par fluorescence ou de radiomarquage, de colorants chromogènes ou la formation de diaminobenzidine, etc.
Méthodes de détection
La détection de la lumière, l’autoradiographie et les changements de couleur sont utilisés comme méthodes de détection en Southern blot.Les méthodes de détection en western blot sont les changements de couleur et la détection de la lumière, etc.
Application
Southern blot est utilisé dans la détection de l'ADN, le test de paternité, le doigté de l'ADN, l'identification de la victime, l'identification des criminels, la recherche d'agents infectieux et l'identification de mutations ou de réarrangements de gènes, etc.Le Western blot est utilisé pour rechercher le nombre de protéines dans un mélange, pour détecter la présence de VIH, de virus, de bactéries, etc. dans le sérum, pour rechercher les protéines défectueuses et comme mesure définitive de l'herpès, de l'hépatite B, de la maladie de Lyme. la maladie et la maladie de Creutzfeldt-Jacob, etc.

Qu'est-ce que le Southern blotting??

Southern blot est la méthode de buvardage la plus ancienne donnée par Edwin Southern, elle est appelée Southern blot. Il est utilisé pour rechercher une séquence spécifique d'ADN dans un échantillon ou un mélange donné. Les étapes impliquées pendant le transfert Southern sont l'électrophorèse, le transfert et la détection de séquences spécifiques. Tout d'abord, l'ADN est fragmenté à l'aide d'une enzyme de restriction spécifique. Ensuite, les fragments d'ADN désirés sont séparés par électrophorèse sur gel. Ces fragments sont dénaturés à l'aide d'une solution alcaline, par exemple NaOH, etc. pour séparer les deux brins d'ADN. Ces fragments d'ADN simple brin ont ensuite été transférés sur une membrane par transfert. Cet ADN lié à la membrane est ensuite traité avec une sonde marquée. Cette sonde se fixera à son brin complémentaire sur l'ADN membranaire qui pourra être visualisé par autoradiogramme, etc.


Qu'est-ce que le Western Blotting??

La méthode Western blot a été inventée par le groupe de George Stark de l’Université de Stanford, qui est utilisée pour identifier une séquence spécifique d’acides aminés dans la protéine. Il est également connu sous le nom de protéine blot ou immuno-blot. Les étapes du Western Blot sont l’électrophorèse, le transfert et la détection de protéines spécifiques. Tout d’abord, homogénéiser le mélange. Ensuite, séparez la molécule d'intérêt à l'aide de l'électrophorèse. Transférez ces molécules sur la membrane et identifiez la protéine spécifique en utilisant une sonde spécifique.

Différences Clés

  1. Une technique utilisée pour rechercher une séquence d'ADN spécifique dans un mélange donné est connue sous le nom de transfert Southern, alors qu'une technique utilisée pour rechercher une séquence d'acides aminés spécifique de la protéine dans un mélange donné est appelée transfert Southern.
  2. Southern blot a été développé par Edward M. Southern en 1975, il est connu sous le nom de Southern blotting. D'autre part, le western blot a été développé par le groupe de George Stark à l'Université de Stanford en 1979.
  3. Le transfert de Southern est utilisé pour trouver une séquence d'ADN spécifique. Inversement, le Western Blot est utilisé pour rechercher un acide aminé spécifique ou une séquence protéique.
  4. Southern blot fonctionne sur le principe de l'hybridation sur le revers; Western blot fonctionne sur le principe de la méthode d'immunodétection ou de l'interaction antigène-anticorps.
  5. Un ADN simple brin ou parfois un ARN est utilisé comme sonde dans le transfert de Southern de l'autre côté, tandis que dans le transfert de Western, les anticorps primaires et secondaires sont utilisés comme sonde.
  6. L'électrophorèse sur gel d'agarose est utilisée dans le transfert Southern, alors que le gel SDS PAGE / Polyacrylamide est utilisé pour séparer les protéines dans le transfert Western.
  7. Southern blot suit la procédure de transfert capillaire, d'autre part; Western Blotting suit la procédure de transfert électrique.
  8. Pendant le transfert Southern, l’échantillon doit être dénaturé, alors que lors du transfert Western, il doit être dans son état natal.
  9. Aucune étape comme le blocage n’est impliquée dans le transfert Southern sur le revers, lors du transfert Western, des sites d’anticorps non spécifiques sont bloqués sur le papier de nitrocellulose à l’aide de poudre de lait ou de sérum albumine bovine (BSA).
  10. Les méthodes de marquage couramment utilisées dans le transfert Southern sont l'utilisation de colorants chromogéniques ou le marquage par radiomarquage ou fluorescent, etc.
  11. La détection de la lumière, l’autoradiographie et les changements de couleur sont utilisés comme méthodes de détection dans le transfert Southern, alors que les méthodes de détection dans le transfert Western sont les modifications de couleur et la détection de la lumière, etc.
  12. Le Southern blot est utilisé dans la détection de l'ADN, les tests de paternité, le doigté ADN, l'identification des victimes, des criminels, des agents infectieux, des mutations ou des réarrangements géniques, etc. mélange, pour détecter la présence de VIH, de virus, de bactéries, etc. dans le sérum, pour rechercher des protéines défectueuses et utilisé comme mesure définitive de l'herpès, de l'hépatite B, de la maladie de Lyme et de la maladie de Creutzfeldt-Jacob, etc.

Conclusion

La discussion ci-dessus résume le fait que la technique de transfert de Southern est la plus ancienne technique utilisée pour rechercher un segment d’ADN spécifique dans un échantillon, tandis que la technique de transfert de Western a été découverte et utilisée pour identifier une séquence spécifique d’acides aminés ou une protéine spécifique.

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